За 30 лет оккупации был нанесен большой экологический ущерб территориям Азербайджана, захваченным армянскими вооруженными формированиями,
Более 60 гектаров зеленых территорий было полностью вырублено. Были вырублены и сожжены корни около 130 деревьев возрастом от 500 до 1000 лет, наделенных экологическим паспортом.
Было разграблено много рудников полезных ископаемых, как цветные металлы (золото, серебро, медь, молибден и др.), а также строительное сырье.
При эксплуатации этих месторождений не были соблюдены никакие экологические стандарты и нормативы, вследствие чего они сильно загрязнены и нуждаются в восстановлении.
На многих реках были нелегально построены малые гидроэлектростанции, без соблюдения нормативов по безопасности экосистемы этих рек.
Экологическая ситуация усугублялась тем, что начиная с июня 2006 года армяне целенаправленно устраивали поджоги, уничтожая лесные участки, в том числе в заповедных зонах. Поджигались оккупированные села Агдамского, Физулинского, Джебраильского, Тертерского и Ходжавендского районов. Учиненные армянами поджоги перекидывались и на территории, подконтрольные Азербайджану. Только в результате 20-дневных пожаров в 2006 году в общей сложности были сожжены 132,2 кв. км территорий.
Массовому истреблению подверглись восточный чинар, ореховые деревья ценнейших пород, произраставшие в Топмеше в Зангиланском районе. Здесь же уничтожен второй по счету во всем мире и первый в Европе лес восточных платанов (чинара). За время оккупации армянами неоднократно были совершены поджоги в лесах Бартаз, Веджнели, Дашбашы и Лешкар.
Вырублены окружавшие эти лесные массивы 40-50-летние ореховые деревья на общей площади 55 га. В лесных массивах Топ и Шюкюратаз уничтожены 350-400-летние дубовые деревья.
Ущерб от пожаров в 2007 году, оценивался в размере более 15 млн. манатов ($18,2 млн. по текущему курсу), а в 2006 году 159 млн. манатов ($193 млн.).
Правительство Азербайджана неоднократно привлекало внимание международной общественности к бедственному экологическому положению в Нагорном Карабахе и прилегающих оккупированных районах. Результатом стало принятие 7 сентября 2006 года на 60-й сессии Генеральной Ассамблеи ООН шестой по счету резолюции (№60/285) со времени начала армяно-азербайджанского конфликта. В своей резолюции "Положение на оккупированных территориях Азербайджана" в связи с участившимися пожарами и, как следствие, нанесением огромного ущерба экологии региона Генассамблея, будучи серьезно обеспокоена таким положением дел, подчеркнула необходимость безотлагательного проведения экологической операции для тушения пожаров и преодоления их пагубных последствий.
Вопросы поджогов и экологического террора Армении против Азербайджана поднимались азербайджанской делегацией и на сессиях в ПАСЕ. С целью оценки краткосрочного и долгосрочного воздействия преднамеренных поджогов и создавшейся в связи с этим опасной экологической ситуацией в рамках ОБСЕ были созданы оценочная миссия и комиссия в составе международных экспертов.
Однако армянская сторона не выполнила решения о совместных мероприятиях, принятые после завершения миссии. Поджоги на захваченных землях продолжились в последующие три года. Последние возгорания были зафиксированы 20 июля 2009 года. "Учиненный вооруженными силами Армении с вечера 20 июля пожар в оккупированных горных массивах Агдамского и Агдеринского районов распространялся с большой скоростью. Огонь можно было увидеть на возвышенностях не только в Агдаме, Агджабеди, Барде и Тертере, но и в более дальних районах", - говорится в отчетах Минэкологии Азербайджана.
Земли на ранее оккупированных территориях Кяльбаджарского, Лачинского, Губадлинского, Зангиланского, Джебраильского, Физулинского и Агдамского районов вокруг Нагорного Карабаха не возделывались, что привело к большому экологическому бедствию.
Почти все реки, берущие свое начало в Армении, впоследствии, вливаясь на территории Азербайджана в Куру и Араз, впадают затем в Каспийское море. На протяжении многих лет реки Охчучай, Занги, Араз, Агстафа и другие, протекающие по Армении, загрязняли своими водами реки Азербайджана. Как следствие, ранее оккупированный Арменией Зангиланский район Азербайджана стал зоной-жертвой масштабного экологического террора.
По данным Минэкологии, со стороны Армении регулярно в реки района сливались 2,1 тыс. кубометров загрязненных вод в день. Загрязненная вода сливалась в реку Араз посредством его левого ответвления Охчучая. Химически загрязненные воды с расположенных на территории Армении Гачаранского медно-молибденового и Гафанского рудоочистительного комбинатов сливались в левое ответвление реки Араз без очистки. В результате бассейн реки был превращен в мертвую зону. Микрофлора и фауна реки полностью уничтожены.
Имеются данные о захоронении отработанных радиоактивных отходов Армянской АЭС на территориях оккупированных районов Азербайджана. Оставшиеся после военных действий минные поля, огромное количество гильз снарядов, тяжелая военная техника, передвигающаяся в горных районах, нанесли большой урон растительному миру и почвенному покрытию.
После победы Азербайджана в 44 дневной Отечественной войне и освобождения территорий от армянской оккупации одним из приоритетов Министерства экологии и природных ресурсов являются лесовосстановительные работы на освобожденных территориях и осуществляемые в этом направлении проекты. До оккупации около 228-230 тысяч гектаров этих территорий были покрыты лесом. Эти леса были намеренно сожжены и эксплуатированы. Уничтожено более 54 тысяч гектаров земли. На территории Губадлинского, Физулинского и Джебраильского районов восточные чинары возрастом 1600, 900 и 500 лет подверглись экологическому терроризму. В настоящее время на наших территориях, освобожденных от оккупации, государством предпринимаются важные действия по ликвидации последствий экологического терроризма, совершаемого армянскими сепаратистами а также по восстановлению флоры и фауны.
В целях устранения последствий экологического терроризма, помимо строительства «Леса Дружбы» и террас, на освобожденных от оккупации территориях строятся и умные рассадные зоны. В Карабахском и Восточно-Зангезурском экономических районах ведутся работы по лесоразведению и лесовосстановлению. Международная практика используется для очистки рек, пострадавших от химического загрязнения.
